Vụ lúa ĐX 2009-2010 mới bắt đầu nhưng hiện nay nông dân một số tỉnh ở ĐBSCL tái diễn tình trạng xuống giống lúa IR 50404. Theo lý giải của bà con nông dân, làm giống IR 50404 dễ chăm sóc, năng suất cao và bán giá chỉ chênh lệch với các giống lúa chất lượng cao khác từ 200-300 đ/kg.
Một cơ sở sản xuất và cung ứng lúa giống ở Trà Vinh cho biết, đến thời điểm này cơ sở đã cung ứng khoảng 300 tấn giống IR 50404 cho nông dân các tỉnh ĐBSCL. Riêng tại huyện Tháp Mười, tỉnh Đồng Tháp cơ sở đã cung ứng trên 60 tấn lúa giống IR 50504.
Hiện tại, các địa phương khuyến cáo nông dân hạn chế tối đa gieo sạ giống IR 50404, khống chế dưới mức 15 – 20 % diện tích. Vì giống này tỷ lệ bạc bụng rất cao, chất lượng hạt gạo không đảm bảo xuất khẩu. Trước thực trạng trên, nên chăng VFA sớm đưa ra tiêu chuẩn thu mua lúa IR 50404.
