Ông Ngân là giảng viên bộ môn Ngân hàng tại Trường Đại học Kinh tế TP.HCM. Năm 1996 được bổ nhiệm là Phó trưởng khoa Tài chính doanh nghiệp - Kinh doanh tiền tệ, sau đó là Phó hiệu trưởng Đại học Kinh tế TP.HCM.
Năm 2002, ông được phong hàm Phó giáo sư. Năm 2015, ông là Hiệu trưởng Đại học tài chính Marketing. Đến năm 2016 được bổ nhiệm là Giám đốc Học viện cán bộ TP.HCM. Năm 2015 tại Đại hội Đảng bộ TP Hồ Chí Minh, ông được tín nhiệm bầu vào BCH Đảng bộ TP nhiệm kỳ 2015 - 2020. Ông từng là thành viên Hội đồng tư vấn chính sách tài chính tiền tệ quốc gia (2007 - 2015). Ông Ngân là ĐBQH khóa XIII và XIV thuộc đoàn đại biểu Quốc hội TP.HCM.