Thời gian qua, Nhà nước có quy định ưu đãi cho hoạt động chế biến nông sản, lâm sản, thủy sản nhưng lại chưa có quy định nêu rõ rằng hoạt động SX đường từ nguyên liệu mía cũng thuộc ngành được hưởng ưu đãi. Sau khi xét đề nghị của Bộ Tài chính và ý kiến tham mưu của các đơn vị liên quan, ngày 13/9/2010, Phó Thủ tướng Thường trực Nguyễn Sinh Hùng đã có ý kiến chỉ đạo gỡ nút vướng này cho DN.
Cụ thể, ông Phạm Sỹ - Phó Vụ trưởng Vụ Kinh tế Tổng hợp Văn phòng Chính phủ cho biết, việc ưu đãi đầu tư cho các công ty mía đường hiện đang được áp dụng theo một số văn bản quy phạm pháp luật như Nghị định 44/1998/NĐ-CP ngày 29/6/1998 và Nghị định 51/1999/NĐ-CP ngày 8/7/1999. Tuy nhiên, trong văn bản quy phạm pháp luật khi đó chưa nêu rõ "hoạt động sản xuất đường từ nguyên liệu mía" có thuộc ngành nghề được hưởng ưu đãi đầu tư theo Nghị định 51/1999/NĐ-CP hay không. Bộ NN- PTNT thì cho rằng ngành mía đường cần được hưởng chính sách ưu đãi đầu tư theo Luật Khuyến khích đầu tư trong nước. Bởi SX đường từ mía thuộc ngành chế biến nông sản, vùng nguyên liệu mía gắn bó với đời sống của hàng triệu nông dân. Bộ Công Thương cũng có ý kiến rằng hoạt động chế biến SX đường từ nguyên liệu mía được coi là "công nghiệp chế biến nông sản".
Trên cơ sở đó, Bộ Tài chính đã có công văn đề nghị Thủ tướng Chính phủ cho phép các DN SXKD mía đường, có hoạt động SX mía đường từ nguyên liệu mía thì hoạt động này thuộc ngành nghề chế biến nông sản, lâm sản, thủy sản và được hưởng ưu đãi đầu tư theo Nghị định 51/1999/NĐ-CP.