Đây là DA trọng điểm, do Cục Hàng hải VN làm chủ đầu tư được tái khởi động sau một thời gian dài đình hoãn do thiếu vốn. Trên cơ sở đề nghị của Bộ GTVT, Thủ tướng Chính phủ đã đồng ý cho phép khởi động lại DA và điều chỉnh quy mô với tổng mức đầu tư 9.781 tỷ đồng từ nguồn trái phiếu Chính phủ.
Giai đoạn thông luồng kỹ thuật của DA sẽ thực hiện từ nay đến 2015 với các hạng mục như: Xây dựng đê chắn sóng phía Nam; nạo vét luồng cho tàu 10.000 tấn đầy tải, tàu 20.000 tấn giảm tải với chiều dài 46,5km. Xây bến phà và đường dẫn xuống phà tại hai bờ Trà Cú và Duyên Hải.
Ngoài ra, trang bị 2 phà trọng tải 60 tấn và các công trình phụ; xây dựng nhà đảm bảo an toàn hàng hải, trang bị hệ thống phao tiêu báo hiệu luồng.
Giai đoạn từ 2016 - 2017, hoàn thành các hạng mục còn lại đảm bảo tính ổn định, đồng bộ, đảm bảo dân sinh khu vực ĐBSCL.