Việc thiết lập và đưa vào hoạt động các Văn phòng EOC là một trong những hành động cụ thể của Việt Nam trong việc thực hiện những cam kết của mình trong việc tham gia Chương trình Hợp tác An ninh Y tế toàn cầu đồng thời cũng thể hiện sự giúp đỡ nhiệt tình và hiệu quả của Chính phủ Hoa Kỳ thông qua tổ chức USCDC, PATH, DTRA, và các tổ chức quốc tế khác trong công tác phòng chống dịch bệnh tại Việt Nam.
Văn phòng EOC Quốc gia đặt tại Bộ Y tế đã được khởi động từ tháng 2/2015, qua thời gian hoạt động đã cho thấy hiệu quả trong phòng chống dịch bệnh như Ebola, cúm A, Zika...