Hàng năm, Chi cục Thú y chủ trì và phối hợp với các đơn vị liên quan xây dựng, trình cấp có thẩm quyền phê duyệt và tổ chức triển khai kế hoạch phòng, chống dịch bệnh động vật thuỷ sản theo các bước sau:
Tổng hợp, phân tích, đánh giá kết quả và chỉ rõ những nguyên nhân vướng mắc, tồn tại, bất cập trong việc tổ chức thực hiện kế hoạch của năm đang thực hiện; đánh giá cụ thể về vai trò, tầm quan trọng, hiện trạng và xu hướng phát triển nuôi trồng thủy sản của địa phương; tổng hợp, phân tích số liệu diện tích nuôi các động vật thủy sản chủ lực tại địa phương; xác định các nguồn lực cần thiết… báo cáo Sở NN-PTNT để Sở trình UBND cấp tỉnh phê duyệt kế hoạch và dự toán kinh phí trước ngày 30/11 hằng năm.
Nội dung kế hoạch phòng, chống dịch bệnh động vật thuỷ sản như sau: Giám sát dịch bệnh động vật thủy sản; điều tra ổ dịch, các biện pháp xử lý ổ dịch, chống dịch; dự trù vật tư, hóa chất, kinh phí và nguồn nhân lực để triển khai các biện pháp phòng, chống, hỗ trợ cho chủ cơ sở nuôi khi công bố dịch và cả khi dịch bệnh xảy ra nhưng chưa đủ điều kiện công bố dịch; dự trù các trang thiết bị cần đầu tư, bổ sung, hiệu chỉnh để phục vụ công tác chẩn đoán xét nghiệm, giám sát, điều tra ổ dịch, xây dựng bản đồ dịch tễ và phân tích số liệu.
Ngoài ra phải kiểm dịch giống; kiểm tra vệ sinh thú y; kiểm tra việc quản lý, kinh doanh, sử dụng thức ăn, chế phẩm sinh học, chất xử lý cải tạo môi trường thuốc thú y, vắc xin, hóa chất tại địa phương; thông tin, tuyên truyền, tập huấn cho người nuôi trồng thủy sản, nhân viên thú y xã, công chức, viên chức thú y thủy sản; họp sơ kết, tổng kết, phân tích và nhận định tình hình dịch bệnh; đánh giá các biện pháp phòng, trị bệnh đã triển khai và đưa ra những điều chỉnh phù hợp và hiệu quả…
Công bố dịch bệnh động vật thủy sản phải bảo đảm đủ điều kiện, đúng thẩm quyền, công khai, chính xác, kịp thời. Trong thời hạn 24 giờ, kể từ khi nhận được đề nghị công bố dịch bệnh động vật, Chủ tịch UBND cấp tỉnh quyết định công bố dịch bệnh, chỉ đạo các cơ quan, ban, ngành, tổ chức, cá nhân có liên quan của địa phương thực hiện các biện pháp chống dịch theo quy định của Luật Thú y.
Sau ít nhất 15 ngày kể từ ngày xử lý xong ổ dịch cuối cùng mà không phát sinh ổ dịch mới và đã thực hiện các biện pháp quy định của Luật Thú y, Chi cục Thú y đề nghị Cục Thú y thẩm định điều kiện công bố hết dịch.
Thông tư số 04/2016/TT-BNNPTNT cũng quy định rõ trách nhiệm của Cục Thú y, Tổng cục Thủy sản, cơ quan quản lý chất lượng, cơ quan quan trắc môi trường, UBND các cấp, Sở NN-PTNT các tỉnh/thành phố, Chi cục Thú y, Chi cục Thủy sản và cá nhân, tổ chức nuôi trồng thủy sản.
