Qua 2 năm Chung sức xây dựng NTM thì công tác bảo vệ môi trường ở Bến Tre đã đạt kết quả tốt.
Hiện tại, tỷ lệ hộ dân sử dụng nước hợp vệ sinh đạt 82%; số hộ sử dụng nước sạch đạt quy chuẩn quốc gia 36% và tỷ lệ hộ nông thôn sử dụng hố xí hợp vệ sinh đạt 32%. Tỉnh đã hỗ trợ đầu tư 1.564 hầm biogas cho 124 xã NTM từ Dự án QSEAP. Hằng năm đã phân bổ trên 1 triệu cây xanh cho các huyện, thành phố trồng trên các tuyến đường liên huyện, liên xã.
Toàn tỉnh đã hình thành 38 HTX, 52 tổ hợp tác, công nhận 45 làng nghề, cấp giấy chứng nhận 88 trang trại trong lĩnh vực SX nông nghiệp, tạo điều kiện thuận lợi cơ giới hoá, áp dụng tiến bộ KHKT, cung ứng đầu vào, hỗ trợ đầu ra cho sản phẩm nông sản. Đến nay, toàn tỉnh đã xây dựng được 10 mô hình liên kết SX đối với cây lúa, mía, dừa, bưởi da xanh... với tổng diện tích khoảng 1.900 ha.