Nhằm tăng cường đào tạo nguồn nhân lực cho các tỉnh ĐBSCL, Bộ NN-PTNT đã quyết định chuyển Trường Công nhân Cơ khí Nông nghiệp II TW vào đóng tại phường Phước Thới, quận Ô Môn, TP Cần Thơ. Trường có nhiệm vụ đào tạo cán bộ và CNKT cơ điện phục vụ các nông trường quốc doanh, các trạm, đội cơ khí nông nghiệp, các NM mía đường trong khu vực.
Do yêu cầu đào tạo nhân lực phục vụ sự nghiệp CNH, HĐH nông nghiệp, nông thôn, Trường đổi tên thành Trường CĐ Cơ điện và Nông nghiệp Nam bộ, được thành lập theo Quyết định số 986 NN-TCCB/QĐ ngày 23/5/1997 của Bộ NN-PTNT. Với chức năng đào tạo 12 nghề thuộc các nhóm nghề Cơ điện, Kỹ thuật nông nghiệp, Chế biến nông sản thực phẩm, quy mô đào tạo 1.500 học sinh. Như vậy qua 40 năm, từ một trường khi mới thành lập chỉ đào tạo duy nhất 1 bậc nghề CNKT, đến nay Trường đã có năng lực đào tạo đa cấp đa ngành nghề gồm 7 ngành TCCN, 12 nghề TCN. Tới đây sẽ đào tạo 6 ngành bậc CĐ và 5 nghề bậc CĐ nghề có hơn 3.000 HS theo học. Dự kiến đến 2015 quy mô đào tạo đạt hơn 6.000 HS.
Thạc sĩ Lê Thái Dương, Hiệu trưởng Trường CĐ Cơ điện và NN Nam bộ cho biết: Năm 2010, trường dự kiến tuyển khoảng 1.400 chỉ tiêu cho các bậc học. Trong đó, tuyển 550 SV, HS cho các nghề của bậc CĐ, trung cấp và sơ cấp; 400 học sinh của các ngành đào tạo bậc trung cấp chuyên nghiệp. Đặc biệt, năm nay lần đầu tiên trường tuyển 400 SV cho các ngành đào tạo bậc cao đẳng: Cơ khí động lực, Điện công nghiệp và Dân dụng, Chế biến nông sản thực phẩm, Gia công Cơ khí, Điện lạnh. Trong các ngành nghề tuyển sinh của Trường CĐ Cơ điện và NN Nam bộ, năm 2010 có 8 ngành mới đào tạo ở bậc CĐ và TCCN như nuôi trồng thủy sản, chăn nuôi dịch vụ, thú y, chế biến và bảo quản thủy sản, thuốc BVTV.
Trường CĐ Cơ điện và NN Nam bộ không tổ chức thi tuyển. Trường chỉ xét tuyển trên cơ sở kết quả học tập lớp 9, lớp 12 và kết quả thi ĐH.