Theo thống kê của Sở NN-PTNT Hưng Yên, trên địa bàn tỉnh hiện có khoảng 50 loài thủy sản trong đó một số loài quý hiếm vừa có giá trị đa dạng sinh học vừa có giá trị kinh tế như cá cháy, cá mòi cờ chấm, cá mòi cờ hoa, cá lăng, cá ngạnh…
Tuy nhiên, thời gian gần đây nguồn lợi thủy sản của tỉnh này đang bị suy giảm cả về thành phần loài lẫn sản lượng. Nguyên nhân một phần do ô nhiễm môi trường nước, cạn kiệt nguồn nước, một phần do người dân khai thác hủy diệt bằng xung điện, lưới mắt nhỏ, chất độc…
Để bảo vệ nguồn lợi thủy sản, Sở NN-PTNT Hưng Yên đề nghị các địa phương tăng cường công tác kiểm tra, xử lý nghiêm các hành vi khai thác thủy sản vi phạm pháp luật. Cấm khai thác thủy sản trên sông Hồng, sông Luộc trong thời gian từ ngày 1/3 - 31/5 nhằm bảo vệ đường di cư, bãi đẻ trứng của các loại cá di cư như cá cháy, cá mòi cờ chấm, cá mòi cờ hoa. Ngăn ngừa các hành vi xả thải chất độc hại làm ô nhiễm môi trường nước.
Bên cạnh đó đẩy mạnh công tác tuyên truyền về các hình thức khai thác thủy sản bền vững cho người dân được biết. Thả bổ sung giống thủy sản xuống các dòng sông, con kênh, mương nhằm tái tạo lại nguồn lợi và đa dạng sinh thái, thích ứng với biến đổi khí hậu.