Khoảng 16 giờ 30 phút, cơn mưa bắt đầu trút xuống trên nhiều địa bàn TP.HCM.
Trên đường Điện Biên Phủ, mặc dù không ngập, nhưng kẹt xe kéo dài vài cây số, từ cầu Điện Biên Phủ đến vòng xoay Hàng Xanh qua cầu Sài Gòn. Riêng “rốn ngập” là đường Nguyễn Hữu Cảnh, nhiều đoạn sâu đến hơn nửa mét, giao thông tê liệt. Ô tô chen nhau chiếm hết đường xe 2 bánh, nhích từng chút, hàng ngàn người chạy xe máy leo lên lề đường.
Nhiều tuyến đường khác như Ung Văn Khiêm (quận Bình Thạnh); Phan Anh (quận Bình Tân), Phạm Văn Đồng, Tô Ngọc Vân (quận Thủ Đức), Tô Hiến Thành, Ba Tháng Hai, Lê Hồng Phong (Quận 10)… cũng ngập sâu
Theo Đài dự báo khí tượng thủy văn khu vực Nam Bộ, trận mưa chiều 16/6 là trận mưa lớn nhất kể từ đầu mùa mưa đến nay. Tại trạm Tân Sơn Hòa đạt 120mm, trạm Mạc Đĩnh Chi là 61,5 mm. Tại các khu vực quận 12, Tân Bình, Tân Phú, Bình Tân, lượng mưa trung bình khoảng 20 mm. Các khu vực phía Nam TP.HCM gồm quận 7, Nhà Bè, Bình Chánh, Cần Giờ, lượng mưa từ 5-15 mm.
Nguyên nhân gây mưa là do gió Tây Nam với cường độ trung bình, kết hợp với cao áp phía Tây Thái Bình Dương. Rìa Tây Nam áp cao này đẩy ẩm từ biển vào gây mưa lớn tại TP.HCM.
Cơn mưa chiều 16/6 cũng khiến 1 cây phượng trên đường TL 43, phường Tam Bình, quận Thủ Đức bật gốc, đổ vào nhà dân, đè 1 xe máy, rất may không gây thương vong về người.