Được thành lập năm 1988, những ngày đầu Agribank Khánh Hòa phải đối diện với rất nhiều khó khăn, từ một Chi nhánh luôn trong tình trạng thiếu vốn để cho vay, đến năm 2007, Agribank Khánh Hòa đã tự lực được nguồn vốn cho vay.
Trong 30 năm qua, nguồn vốn huy động của Agribank Khánh Hòa liên tục tăng trưởng với tốc độ nhanh và ổn định, tính đến cuối năm 2007, tổng vốn huy động đạt 11.600 tỷ đồng, tốc độ tăng trưởng bình quân 33%/năm. Bên cạnh tăng trưởng huy động vốn thì tín dụng tăng trưởng cũng được nâng cao, đến cuối năm 2017 tổng dư nợ cho vay đạt 7.078 tỷ đồng, chất lượng tín dụng cũng được cải thiện, tỷ lệ nợ xấu từ 12% năm 1989 xuống còn 0,21% tại thời điểm cuối năm 2017.
Suốt 30 năm qua, lĩnh vực được Agribank Khánh Hòa ưu tiên đầu tư vốn là nông nghiệp, nông thôn, đánh bắt, nuôi trồng thủy sản và chế biến nông, thủy sản.
Đến cuối năm 2017, tỷ trọng dư nợ cho vay nông nghiệp, nông thôn chiếm trên 68% tổng dư nợ cho vay và đang phục vụ 32.000 khách hàng. Agribank Khánh Hòa đã triển khai nhiều sản phẩm dịch vụ ngân hàng hiện đại, đến cuối năm 2017 mạng lưới giao dịch của Chi nhánh là 26 điểm, phát triển 42 máy ATM tại tất cả các địa phương của tỉnh với trên 144.000 khách hàng sử dụng thẻ ghi nợ nội địa, gần 1.000 khách hàng sử dụng thẻ quốc tế…
