Cảng Cái Cui hiện nằm chờ, chỉ chế biến mua bán gỗ dăm (cây tràm)
Cho đến nay sau 8 tháng kể từ khi UBND TP Cần Thơ bàn giao cảng Cái Cui về cho TCty Hàng hải Việt Nam quản lý, cảng vẫn năm bất động, chỉ sử dụng làm nơi tập kết mua bán gỗ dăm. Bức xúc trước tình trạng cảng Cái Cui không triển khai đầu tư tiếp giai đoạn 2, mới đây UBND TP Cần Thơ đã tổ chức cuộc họp tìm biện pháp tháo gỡ. Ông Mai Xuân Phúc – TGĐ TCty Hàng hải Việt Nam cho biết, nguyên nhân TCty chưa triển khai giai đoạn 2 vì khi bàn giao giai đoạn 1 còn tồn tại tài chính. 
Mặt khác, thực hiện chủ trương giãn tiến độ đầu tư nhằm kiềm chế lạm phát và hơn nữa chuyển sang giai đoạn 2 phải có tầm nhìn tương lai nên cần khảo sát thiết kế mở rộng bến bãi, nhằm tránh ách tắc trong XNK hàng hóa như cảng TPHCM thời gian qua. Vì vậy việc triển khai giai đoạn 2 sớm nhất cũng diễn ra trong 6 tháng đầu năm 2009.
Dự án cảng Cái Cui khởi công 6/2002, do UBND TP Cần Thơ đầu tư giai đọan 1 với tổng nguồn vốn hơn 212,3 tỉ đồng. Đến năm 2006 cảng hoàn thành bàn giao về TCty Hàng hải Việt Nam. Đây là dự án công trình trọng điểm quốc gia, nằm trong cụm cảng số 6 ở vùng ĐBSCL có có sức thu hút và lan tỏa hàng hóa XNK mạnh thông qua luồng Định An. Hàng năm tính riêng lượng hàng hóa thông qua cụm cảng Cần Thơ đạt 5-7 triệu tấn/năm. Hiện nay tình hình XK hàng hóa nông-thủy sản vùng ĐBSCL vẫn trông cậy chủ yếu vào cảng Cần Thơ hoặc thông qua tuyến quốc lộ độc đạo về TP HCM.
