Đây là hoạt động nằm trong những công tác quản lý chất lượng vật tư nông nghiệp nói chung, thuốc bảo vệ thực vật và phân bón nói riêng do Cục Bảo vệ thực vật (BVTV) thực hiện. Theo đó, Cục BVTV làm việc với Tổng Cục quản lý thị trường và ký kết Quy chế phối hợp trong kiểm tra, kiểm soát thuốc BVTV và phân bón lưu thông trên thị trường.
Thay đổi phương thức thanh tra, kiểm tra; chuyển mạnh từ thanh tra, kiểm tra theo kế hoạch sang thanh tra, kiểm tra đột xuất; phối hợp chặt chẽ với Ban chỉ đạo 389, cơ quan công an, quản lý thị trường trong kiểm tra, kiểm soát việc chấp hành quy định pháp luật trong hoạt động sản xuất, buôn bán thuốc BVTV, phân bón.
Ngoài ra, Cục BVTV đã phối hợp với các Hiệp hội, doanh nghiệp ký cam kết thực hiện sử dụng thuốc BVTV an toàn, hiệu quả, đúng quy định, ưu tiên sử dụng thuốc BVTV sinh học và giảm sử dụng các loại thuốc BVTV hóa học trên đồng ruộng; xây dựng các mô hình sản xuất theo chuỗi giá trị, mô hình sử dụng thuốc BVTV an toàn và hiệu quả; mô hình sử dụng thuốc BVTV trong sản xuất nông nghiệp.
Cho đến nay, chưa phát hiện thấy các tổ chức, đường dây, đầu nậu, và tụ điểm tập kết, buôn bán thuốc BVTV nhập lậu, ngoài danh mục, sản xuất, buôn bán thuốc bảo vệ thực vật giả, kém chất lượng với số lượng lớn. Các vụ việc được phát hiện hầu hết do các tổ chức cá nhân đơn lẻ thực hiện với quy mô và số lượng nhỏ lẻ.
Theo thống kê, có thể điểm lại một số vụ tiêu hủy đã được thực hiện như sau: Năm 2016, Cục BVTV đã tổ chức tiêu huỷ hơn 7 tấn thuốc BVTV nhập lậu, ngoài danh mục, không rõ nguồn gốc, xuất xứ theo quy định pháp luật.
Năm 2018, Cục BVTV đã tổ chức tiêu huỷ gần 3 tấn thuốc BVTV nhập lậu, ngoài danh mục, không rõ nguồn gốc, xuất xứ theo quy định pháp luật. Đến tháng 10/2021, Cục BVTV tổ chức tiêu huỷ gần hơn 6 tấn thuốc BVTV nhập lậu, ngoài danh mục, không rõ nguồn gốc, xuất xứ theo quy định pháp luật.
Trong thời gian tới, Cục BVTV xác định phải kiểm soát tốt các hoạt chất thuốc bảo vệ thực vật chưa được phép sử dụng góp phần đảm bảo an toàn thực phẩm, nâng cao chất lượng nông sản tiêu thụ nội địa cũng như giữ vững uy tín, chất lượng nông sản Việt Nam trên thị trường quốc tế.
Tăng cường hợp tác công tư với sự tham gia của doanh nghiệp, nhà nước, hiệp hội ngành hàng và người dân cùng phối hợp thực hiện sản xuất và sử dụng phân bón hữu cơ, thuốc BVTV sinh học, sử dụng phân bón tiết kiệm trong sản xuất nông nghiệp.
Đẩy mạnh hợp tác công tư, trong đó khuyến khích các doanh nghiệp đầu tư vào liên kết sản xuất an toàn, hiệu quả, bảo vệ môi trường; tranh thủ sự hỗ trợ về nguồn lực của các tổ chức quốc tế cho sự phát triển bền vững, giảm chi phí sản xuất.