Cục Quản lý Đường cao tốc có chức năng tham mưu cho Tổng cục trưởng Tổng cục Đường bộ thực thi nhiệm vụ quản lý Nhà nước chuyên ngành về đường bộ cao tốc.
Cụ thể là xây dựng tiêu chuẩn, quy chuẩn kỹ thuật; tham mưu xây dựng chiến lược, quy hoạch, kế hoạch phát triển mạng lưới đường bộ cao tốc; tham mưu chính sách huy động các nguồn vốn đầu tư, quản lý các dự án đầu tư xây dựng; quản lý khai thác hệ thống đường bộ.
Thực hiện chức năng của cơ quan Nhà nước có thẩm quyền đối với các dự án xây dựng công trình đường bộ cao tốc theo hình thức hợp đồng BOT, BTO, BT và các hình thức đầu tư PPP khác theo phân cấp, ủy quyền của Bộ Giao thông Vận tải...
