Viện Nghiên cứu Nuôi trồng Thủy sản II tinh gọn bộ máy, sắp xếp, bố trí nhân sự phù hợp, nâng cao năng lực nghiên cứu, đáp ứng nhu cầu thực tiễn, cải thiện đời sống người lao động.
Thực hiện cuộc cách mạng công nghiệp lần thứ tư và để đáp ứng yêu cầu của Bộ NN-PTNT về công tác cải cách hành chính và thực hiện thành công Chiến lược phát triển KHCN Viện đến năm 2030 và tầm nhìn đến năm 2045, lãnh đạo Viện Nghiên cứu Nuôi trồng Thủy sản II luôn quan tâm đến công tác cải cách hành chính, tập trung nguồn lực hiện có để có thể thực hiện cải cách hành chính đạt hiệu quả cao nhất.
Viện Nghiên cứu Nuôi trồng Thuỷ sản II đã thực hiện tinh gọn bộ máy một đầu mối trực thuộc Viện, từ 11 giảm xuống còn 10. Trong đó, Khối nghiệp vụ gồm Phòng Tổ chức - Hành chính; Phòng Kế hoạch - Tài chính; Phòng Khoa học, Hợp tác quốc tế và đào tạo.
Khối nghiên cứu, triển khai, ứng dụng gồm Phòng Sinh thái nghề cá và Tài nguyên thủy sinh vật; Trung tâm Công nghệ sinh học thủy sản; Trung tâm Quan trắc Môi trường và Bệnh thủy sản Nam Bộ; Trung tâm Công nghệ thức ăn và Sau thu hoạch thủy sản; Trung tâm Quốc gia giống thủy sản nước ngọt Nam Bộ; Trung tâm Quốc gia giống hải sản Nam Bộ; Phân viện Nghiên cứu Thủy sản Nam sông Hậu.
Các đơn vị trực thuộc Viện cũng tinh gọn bộ máy 21 đầu mối trực thuộc, từ 44 giảm xuống còn 23.
Bên cạnh đó, Viện cũng tinh gọn bộ máy, sắp xếp, bố trí nhân sự phù hợp theo tinh thần của Đề án vị trí việc làm với mục tiêu tinh giản biên chế, chấm dứt hợp đồng lao động đối với những trường hợp không hoàn thành nhiệm vụ hoặc không đáp ứng yêu cầu công việc. Từ đó, số lượng nhân sự giảm dần theo từng năm.
Chính việc sắp xếp tổ chức tinh gọn bộ máy, bố trí nhân sự theo hướng tinh gọn, giúp giảm đi sự trì trệ vốn có, nâng cao trách nhiệm của người đứng đầu, tạo động lực cho viên chức, người lao động trong việc thực hiện cơ chế tự chủ. Từ đó, giúp cho mọi hoạt động của Viện Nghiên cứu Nuôi trồng Thủy sản II ngày một khởi sắc hơn; có nhiều đề tài, dự án hơn; phát triển các dịch vụ khảo nghiệm, kiểm nghiệm, nâng cao thu nhập, cải thiện đời sống người lao động ngày một tốt hơn.
Viện Nghiên cứu Nuôi trồng Thủy sản II ứng dụng công nghệ vào công tác quản lý, điều hành, chuyên môn, nghiệp vụ, tăng cường sử dụng hệ thống văn bản điện tử trong nội bộ, đem lại hiệu quả cao nhất. Đặc biệt, chuyển đổi số được ứng dụng triệt để đối với bộ phận quản lý khoa học công nghệ.Hiện Viện Nghiên cứu Nuôi trồng Thủy sản II có 164 người lao động, trong đó, 10 cán bộ có trình độ Tiến sĩ, 48 người có trình độ Thạc sĩ được đào tạo chuyên sâu tại các nước phát triển như Hoa Kỳ, Anh, Australia, Bỉ, Hà Lan, Na Uy, Nhật Bản, Hàn Quốc,…
Xây dựng đội ngũ nghiên cứu viên vừa giỏi về chuyên môn, vừa có kinh nghiệm thực tiễn là yêu cầu cấp bách mà Viện Nghiên cứu Nuôi trồng Thủy sản II đặt ra trong thời gian tới, từ đó giúp cho các đề tài nghiên cứu sâu sát hơn, vừa phù hợp với yêu cầu của nhà nông, của doanh nghiệp, cũng như của từng địa phương, vừa có tính khả thi khi ứng dụng trong thực tiễn.
