Các đại biểu đánh giá thuỷ sản là ngành kinh tế sản xuất hàng hoá lớn nhưng các hoạt động sản xuất thường gặp rủi ro về môi trường và thị trường. Những “căn bệnh” vẫn còn xảy ra như chạy theo sản lượng, coi trọng khai thác mà chưa quan tâm đến lợi ích môi trường lâu dài. Hiện trạng môi trường khu vực bị ô nhiễm, dịch bệnh tôm có điều kiện lây lan nhanh, hoặc nhập giống ngoại mang mầm bệnh vào các ao nuôi…
Qua đó, nhiều ý kiến cho rằng nên có chiến lược phát triển thuỷ sản bền vững bằng việc quy hoạch bền vững, hình thành thiết chế tổ chức và cơ chế điều hành vừa có những phân tích, dự báo nhằm kiểm soát quá trình phát triển theo quy hoạch.