Tuy nhiên, lưu lượng đến của đập Liễn Sơn ngày càng cạn kiệt. Bên cạnh đó, mực nước sông Hồng, sông Lô những năm gần đây cũng bị giảm mạnh, không đảm bảo mực nước thiết kế cho trạm bơm Bạch Hạc và Đại Định họat động, gây khó khăn không nhỏ cho sản xuất nông nghiệp đặc biệt là vụ chiêm xuân.
Ngoài ra, hệ thống thủy lợi Liễn Sơn được xây dựng hơn 9 thập kỷ. Do đó mặc dù được tu bổ sửa chữa công trình hàng năm nhưng kinh phí dành cho bảo dưỡng chỉ chiếm khoảng 10% thuỷ lợi phí thu được nên công trình xuống cấp rất nghiêm trọng.
