Trước khi bổ nhiệm, ông Đặng Văn Huấn là chuyên viên chính của Vụ Giáo dục đại học, thư ký lãnh đạo Bộ Giáo dục và Đào tạo. Ông có thâm niên hơn 20 năm công tác trong ngành giáo dục, từng công tác tại nhiều đơn vị trong Bộ như Vụ Hợp tác quốc tế, Vụ Giáo dục đại học, Phòng Tổng hợp, Văn phòng Bộ.
Là cử nhân về Quan hệ quốc tế tại Học viện Ngoại giao Việt Nam, chuyên nghành Kinh tế quốc tế, ông Huấn đã hoàn thành chương trình chuyển đổi tại trường Đại học Ngoại Thương Hà Nội với các môn nền tảng về thương mại và đầu tư quốc tế.
Sau đó, ông tốt nghiệp thạc sĩ Hành chính công tại Trường đại học Roger Williams, Bang Rhode Island, Hoa Kỳ. Kế tiếp là tiến sĩ ngành Chính sách công và quản lý nhà nước tại Trường Quản lý nhà nước Hatfield, Đại học Portland State, Bang Oregon, Hoa Kỳ.
Với nhiều năm kinh nghiệm trong lĩnh vực giáo dục, TS Đặng Văn Huấn luôn tâm huyết với các dự án về chuyển đổi số trong giáo dục; vận dụng giáo dục STEAM cho các lớp THCS và THPT, xây dựng chương trình, tài liệu, học liệu phục vụ cho bồi dưỡng giáo viên, cán bộ quản lý giáo dục theo hình thức trực tuyến; phát triển giáo dục thông minh, trường đại học thông minh.
Từ năm 2015 đến 2016, TS Đặng Văn Huấn là chuyên viên phụ trách mảng quan hệ giáo dục và đào tạo giữa Việt Nam và Hoa Kỳ, Vụ Hợp tác Quốc tế. Sau đó, ông công tác tại Vụ Giáo dục đại học và Văn phòng Bộ Giáo dục và đào tạo.
Từ tháng 6/2020, ông Huấn giữ chức Phó giám đốc Ban quản lý Chương trình phát triển các trường đại học sư phạm để bồi dưỡng năng lực cho giáo viên và cán bộ quản lý các trường giáo dục phổ thông.
Ở vị trí này, ông phụ trách các hoạt động như: phát triển năng lực của 8 trường đại học sư phạm trọng điểm; xây dựng chương trình và triển khai bồi dưỡng thường xuyên cho đội ngũ giáo viên và hiệu trưởng, hiệu phó các trường phổ thông trên toàn quốc, phục vụ việc triển khai Chương trình giáo dục phổ thông 2018.
Năm 2023, ông Huấn được bổ nhiệm làm Giám đốc Dự án Nâng cao chất lượng giáo dục đại học của Bộ Giáo dục và Đào tạo do Ngân hàng thế giới tài trợ để đầu tư phát triển Đại học Bách khoa Hà Nội, Học viện Nông nghiệp Việt Nam, Trường Đại học Kinh tế Quốc dân.
Đồng thời, tham gia nâng cao năng lực quản lý của Bộ Giáo dục và Đào tạo thông qua việc phát triển hệ thống cơ sở dữ liệu giáo dục đại học (HEMIS) và hỗ trợ công tác kiểm định chất lượng giáo dục đại học.
Tân phó vụ trưởng từng là giảng viên thỉnh giảng môn Phân tích chính sách công và Quản lý công cho Chương trình Thạc sỹ Chính sách công của Học viên Chính sách và Phát triển, Bộ Kế hoạch và Đầu tư; giảng viên thỉnh giảng cho Chương trình tiên tiến về quản lý công của Trường Đại học Kinh tế Quốc dân.