Sáng 9/5/2019, 9 cửa hàng bán lẻ điện thoại tại Hà Nội và một trung tâm bảo hành của Nhật Cường Mobile đồng loạt bị Bộ Công an khám xét.
Vụ án Buôn lậu và Vi phạm quy định về kế toán gây hậu quả nghiêm trọng được khởi tố.
Từ hôm đó, các cửa hàng đồng loạt của Nhật Cường Mobile ngừng kinh doanh và tới nay vẫn chưa hoạt động trở lại.
Sau đó, Bộ Công an khởi tố GĐ Nhật Cường Mobile Bùi Quang Huy và 8 người liên quan đến vụ án, nhưng Huy đã bỏ trốn (đến nay vẫn chưa bị bắt và đang bị truy nã đỏ từ tháng 9/2019).
Mở rộng vụ án Nhật Cường Mobile, Bộ Công an có văn bản đề nghị Chủ tịch UBND Hà Nội Nguyễn Đức Chung phối hợp cung cấp thông tin, tài liệu liên quan để phục vụ điều tra, do TP Hà Nội đã phê duyệt dự bán công nghệ của Công ty TNHH giải pháp phần mềm Nhật Cường (Nhật Cường Software, công ty con của Nhật Cường Mobile).
Tính đến nay, có tổng cộng 28 người bị khởi tố có liên quan đến vụ đại án Nhật Cường Mobile. Trong đó có một số người từng giữ chức vụ quan trọng của thành phố, như:
- Ông Nguyễn Văn Tứ, Chánh Văn phòng Thành ủy;
- Bà Phạm Thị Thu Hường, Chánh Văn phòng Sở Kế hoạch và Đầu tư;
- Ông Nguyễn Tiến Học, cựu phó giám đốc Sở Kế hoạch và Đầu tư;
- Bà Phạm Thị Kim Tuyến, Trưởng phòng Đăng ký kinh doanh, Sở Kế hoạch và Đầu tư.
Tháng 11/2019, đánh giá mức độ sai phạm của vụ án Nhật Cường Mobile là nghiêm trọng, phức tạp, Thường trực Ban chỉ đạo Trung ương về phòng, chống tham nhũng đã đưa vụ án vào diện theo dõi, chỉ đạo.
Tháng 7/2020, Anh trai Bùi Quang Huy bị bắt.
Vài ngày sau, lái xe riêng của Chủ tịch Nguyễn Đức Chung là Nguyễn Hoàng Trung và ông Nguyễn Anh Ngọc, Phó trưởng Phòng thư ký biên tập thuộc Văn phòng UBND Hà Nội bị bắt vì cáo buộc "chiếm đoạt tài liệu mật". Được tách ra thành vụ án riêng Chiếm đoạt tài liệu bí mật nhà nước.
Ngày 11/8/2020, Chủ tịch UBND TP Hà Nội Nguyễn Đức Chung bị Thủ tướng đình chỉ công tác 90 này để phục vụ "điều tra trách nhiệm có liên quan trong một số vụ án".