Trung tâm được thành lập theo quyết định số 1085/QĐ-BNN-TCCB ngày 14/5/2013 của Bộ NN-PTNT và chính thức đi vào hoạt động từ 1/1/2015 với 4 đơn vị trực thuộc gồm, trại vịt giống ở huyện Bến Cát (Bình Dương); trại gà Bình Thắng ở TX Dĩ An (Bình Dương); trại gà giống; trại ấp trứng gia cầm tại huyện Trảng Bom (Đồng Nai).
Trung tâm có chức năng nghiên cứu khoa học, chuyển giao công nghệ, nuôi giữ giống gốc, huấn luyện, tư vấn, dịch vụ, hợp tác quốc tế trong lĩnh vực chăn nuôi gia cầm. Chuyển giao chủ lực sản phẩm con giống gia cầm 1 ngày tuổi bao gồm giống bố mẹ và thương phẩm vịt siêu thịt, vịt siêu trứng, gà thịt lông màu, trứng gia cầm các loại với tổng công suất khoảng 3,5 triệu con giống/năm.