Trong số các bị cáo có nguyên GĐ Sở KH- ĐT Lương Ngọc Ái, nguyên PGĐ Sở NN- PTNT Lê Mao, nguyên Phó trưởng Ban quản lý dự án thủy lợi Phú Yên- kỹ sư Nguyễn Khánh Tho, GĐ Cty Cơ khí Xây dựng và Lắp máy điện nước Trần Đình Hải, PGĐ XN xây dựng số 3 Lê Thanh Sơn và Chủ nhiệm đề án thiết kế kè Bạch Đằng Mai Trọng Oánh. Phiên tòa có 14 luật sư tham gia bảo vệ cho các bị cáo. Trong đó, bị cáo Mao, Thuận, Hải thuê đến 2 luật sư.
Dự án hệ thống chống ngập lụt TX Tuy Hòa (nay là TP Tuy Hòa) được UBND tỉnh Phú Yên ra quyết định đầu tư xây dựng từ năm 1999 và giao cho Ban quản lý Dự án Thủy lợi Sở NN-PTNT tỉnh Phú Yên làm chủ đầu tư. Để được trúng gói thầu số 4 công trình kè Bạch Đằng (có tổng giá trị xây lắp 20,7 tỷ đồng), Trần Quốc Hoàn, Trần Yên Khánh, Trần Đình Hải, Lê Thanh Sơn đã có hành vi móc ngoặc với Lê Mao và Lương Ngọc Ái nhờ Mao và Ái giúp đỡ cho TCty Cơ khí xây dựng được trúng thầu trước và sau khi trúng thầu Khánh và Sơn đã đưa cho Mao 15.000.000 đồng và 1 điện thoại trị giá 5.000.000 đồng và Hoàn, Khánh, Sơn đã đưa Ái 110.000.000 đồng.
Trong quá trình thi công gói thầu số 4 thuộc công trình kè chống ngập lụt TP Tuy Hòa từ năm 2002 đến năm 2005, Lê Mao, Nguyễn Khánh Tho, Nguyễn Hữu Thuận- cán bộ kỹ thuật Ban quản lý, Mai Trọng Oánh cùng những cán bộ giám sát thi công là Lê Hồng Chương, Tăng Văn Đạo đã thống nhất cho Sơn và Lê Sỹ Tuấn, Phạm Văn Khanh thi công ở hạng mục cọc cừ, cọc neo, dầm neo và tầng lọc không đúng thiết kế kỹ thuật giảm số lượng sắt, bê tông, thi công không đúng chuẩn loại cát và nghiệm thu thanh toán theo thiết kế được duyệt, để Sơn rút ra khỏi công trình chiếm đoạt 155.294,505 kg sắt, 85,182m3 bê tông và chênh lệch giá 4.280m3 cát thô với cát thường, qua đó “rút ruột” với số tiền tổng cộng là 1.030.219.632,4đ chia nhau sử dụng cá nhân.
Riêng Tho còn có hành vi không tổ chức kiểm tra nghiệm thu 122 cọc cừ, 122 cọc neo để Sơn thi công không đúng thiết kế giảm 13.582,2 kg sắt và 6,405m3 bê tông nhưng vẫn nghiệm thu thanh toán theo thiết kế được duyệt gây thiệt hại cho Nhà nước 78.581.600,53 đồng.
Được biết, ngoài hành vi tham ô tài sản, nhận hối lộ tại công trình kè Bạch Đằng, bị cáo Lê Mao còn bị Công an tỉnh Phú Yên khởi tố về tội cố ý làm trái các quy định của Nhà nước về quản lý kinh tế gây hậu quả nghiêm trọng ở công trình cửa Đà Nông ở hạ lưu sông Ban Thạch (Đông Hòa).