Song song với nhiệm vụ đẩy mạnh thực hiện dịch vụ công trực tuyến, để nhiệm vụ cải cách hành chính thực sự mang lại hiệu quả và đi vào trọng tâm, chứ không chỉ đơn thuần dừng lại ở việc công nghệ hóa thông tin các TTHC, trong năm 2017 Bộ NN-PTNT đã tiến hành rà soát toàn bộ các lĩnh vực quản lí để thực hiện chuẩn hóa, cắt giảm, đơn giản hóa hàng loạt thủ tục kiểm tra chuyên ngành khác.
Bộ NN-PTNT cũng đang chỉ đạo mạnh mẽ việc áp dụng nguyên tắc quản lý rủi ro, giảm phương thức kiểm tra truyền thống (kiểm tra trước) và giảm hợp lý dung lượng mẫu kiểm định, kiểm nghiệm, trước hết là đối với thức ăn chăn nuôi nhập khẩu, thuốc thú y nhập khẩu, giống thủy sản nhập khẩu.
Các mặt hàng này được kiểm tra theo tần suất dựa trên mức độ tuân thủ pháp luật của doanh nghiệp hoặc thừa nhận kết quả kiểm tra của quốc gia đối tác theo thông lệ quốc tế.