Mục tiêu của Đề án là nâng cao năng lực bảo đảm an ninh hàng hải nhằm triển khai thực hiện đầy đủ, toàn diện các quy định của Bộ luật Quốc tế về an ninh tàu biển và cảng biển (Bộ luật ISPS).
Đề án cũng nhằm bảo đảm an ninh hàng hải nhằm thu hút đầu tư, phát triển thương mại hàng hải, kinh tế biển, kết hợp chặt chẽ và hiệu quả với nhiệm vụ đảm bảo vững chắc quốc phòng an ninh, khai thác bền vững nguồn tài nguyên biển theo Chiến lược Việt Nam đến năm 2020 và thực hiện Quy hoạch phát triển cảng biển cũng như Quy hoạch phát triển vận tải biển đến năm 2020, định hướng đến năm 2030 đã được phê duyệt.
Đề án được thực hiện theo ba giai đoạn. Cục Hàng hải Việt Nam có nhiệm vụ chủ trì, tổ chức thực hiện đề án. Hàng năm, Cục tổ chức kiểm tra tình hình thực hiện, tổng hợp báo cáo Bộ GTVT; Chỉ đạo các Cảng vụ hàng hải, các doanh nghiệp cảng biển, công ty tàu biển xây dựng Quy chế phối hợp đảm bảo an ninh hàng hải; Xây dựng kế hoạch bảo vệ các công trình bảo đảm an toàn hàng hải hỗ trợ cảng biển trên biển Đông, hải đảo, trình cấp có thẩm quyền phê duyệt hoặc phê duyệt theo thẩm quyền…
