Đến đầu tháng 4/2017, các địa phương đã phê duyệt giá trị bồi thường với tổng số tiền 2.050/2.328 tỷ đồng kê khai thiệt hại ban đầu. Đã giải ngân 1.929 tỷ đồng Trung ương cấp tạm ứng. Một số địa phương (thị xã Ba Đồn, huyện Quảng Trạch, Bố Trạch) đã ứng ngân sách chi trả nên số tiền chi trả được thêm 95 tỷ đồng.
Tỉnh cũng đã đề nghị Trung ương cho phép bổ sung kê khai, bồi thường thiệt hại cho các đối tượng là chủ cơ sở và người lao động trong các cơ sở hoạt động kinh doanh thủy sản; dịch vụ hậu cần nghề cá; thu mua, tạm trữ thủy sản; các đối tượng trong thực tế bị thiệt hại nhưng chưa được kê khai, bồi thường.
Đề nghị bổ sung định mức bồi thường cho các chủ cơ sở đã được kê khai nhưng không thuộc đối tượng được bồi thường hoặc chỉ mới được bồi thường như lao động mất thu nhập mà chưa có định mức bồi thường cho chủ cơ sở (trực tiếp thu mua; sơ chế, chế biến thủy sản; sản xuất, kinh doanh đá lạnh bảo quản hải sản; đóng, sửa tàu thuyền; sản xuất, kinh doanh ngư cụ; kinh doanh dịch vụ du lịch, thương mại...).