Mục đích của Kế hoạch nói trên là quan trắc môi trường vùng nuôi trồng thủy sản phục vụ công tác quản lý, chỉ đạo sản xuất, kịp thời cảnh báo, hướng dẫn biện pháp xử lý, phòng ngừa khi môi trường thủy sản mất an toàn, giảm thiểu thiệt hại do môi trường gây ra, hướng đến phát triển nuôi trồng thủy sản bền vững, hiệu quả.
Theo đó, TP. HCM sẽ tổ chức quan trắc môi trường các đối tượng nuôi chủ lực, có sản lượng và giá trị kinh tế cao như tôm nước lợ (tôm sú, tôm thẻ chân trắng), nhuyễn thể tại các vùng nuôi trọng điểm.
Về tôm nước lợ, sẽ tổ chức quan trắc tại huyện Cần Giờ (xã Lý Nhơn, xã An Thới Đông, xã Tam Thôn Hiệp, xã Bình Khánh), huyện Nhà Bè (xã Hiệp Phước, xã Nhơn Đức), huyện Bình Chánh (xã Phong Phú, xã Đa Phước, xã Bình Lợi).
Với nhuyễn thể, sẽ tổ chức quan trắc tại vùng nuôi nhuyễn thể tập trung ở huyện Cần Giờ, gồm: thị trấn Cần Thạnh, xã Long Hòa, xã Lý Nhơn và xã Thạnh An.
Vùng nuôi nước ngọt, tập trung quan trắc tại huyện Bình Chánh (xã Tân Nhựt), huyện Củ Chi (xã Tân Thông Hội, xã Phước Hiệp) và Thành phố Thủ Đức (phường Phú Hữu).
Chi cục Thủy sản là đơn vị được giao triển khai thực hiện Kế hoạch quan trắc, cảnh báo môi trường trong nuôi trồng thủy sản.
Kết quả quan trắc, cảnh báo môi trường được Chi cục Thủy sản gửi đến các số điện thoại do người dân đăng ký để nhận tin. Trong trường hợp kết quả nguồn nước bị ô nhiễm thì phối hợp với phòng Cảnh sát Môi trường xác định nguyên nhân và xử lý theo quy định của pháp luật.