Năm 2015, Viện Chăn nuôi được Bộ GD-ĐT giao 9 chỉ tiêu đào tạo tiến sĩ. Hiện cơ sở đào tạo Viện Chăn nuôi quản lí 49 nghiên cứu sinh ở 3 chuyên ngành: Chăn nuôi; Dinh dưỡng và thức ăn chăn nuôi; Di truyền và chọn giống vật nuôi.
Trong tổng số 8 nghiên cứu sinh tốt nghiệp, có 7 thí sinh đang công tác tại các đơn vị trực thuộc Viện Chăn nuôi, 1 thí sinh thuộc tỉnh Vĩnh Phúc.
Nhìn chung, công tác tuyển sinh, đào tạo tại Viện được đánh giá là nghiêm túc, đúng quy chế của Bộ GD-ĐT đề ra, trong quá trình tuyển sinh không có thí sinh nào vi phạm quy chế (có 1 ứng viên vì lí do cá nhân xin rút hồ sơ).
Trước những kết quả đã đạt được trong công tác đào tạo năm 2015, TS Nguyễn Thanh Sơn, Viện trưởng Viện Chăn nuôi cho biết: Nhiệm vụ, kế hoạch năm 2016 của Viện là tiếp tục ban hành Quy chế đào tạo tiến sĩ (2016 – 2018), tổ chức tuyển sinh vào 2 đợt dự kiến tháng 3 và tháng 9/2016, tổ chức hội đồng chấm chuyên đề và đặc biệt là tiếp tục phối hợp triển khai đề án đào tạo nguồn nhân lực thông qua thực tiễn SX. Phấn đấu luôn đảm bảo mỗi chuyên ngành đào tạo ít nhất 5 tiến sĩ và có ít nhất 1 GS hoặc PGS.