Hầu hết ở các xã nằm dọc hệ thống thủy lợi Liễn Sơn đều đã có đội thu gom rác thải sinh hoạt theo từng thôn. Tuy nhiên, rác thải sau khi thu gom thường được đổ ở các điểm tự phát chưa có quy hoạch. Rác thường được đổ tập trung ở cuối làng, giữa cánh đồng hay ở ngay cạnh bờ sông Phan như ở thôn Sơn Tang xã Vĩnh Sơn, bãi rác cầu Hương - thị trấn Thổ Tang - huyện Vĩnh Tường...
Tình trạng rác thải sinh hoạt, sản xuất không được thu gom và xử lý triệt để tại các xã ven sông đã và đang gây ra nhiều tác động trực tiếp tới hệ thống thủy lợi Liễn Sơn. Ảnh: TG
Ngoài ra, tại một số xã như Đồng Văn (Yên Lạc), Tề Lỗ (Yên Lạc), Vũ Di (Vĩnh Tường)… có các cơ sở sản xuất làm nghề may mặc, thu gom phế liệu, tháo dỡ thiết bị cơ khí cũ… Rác thải của các làng nghề này một phần nhỏ được các cơ sở tái sử dụng còn phần lớn được đổ thải trực tiếp ngay bên bờ sông Phan.
